海运开始以后，京杭大运河的存在几乎就成了鸡肋，海上是天然的水道，从金陵港口出发北上到北平港口下来，然后运往内地，和使用京杭大运河基本上差不了多少，而且大运河时时刻刻都需要疏通需要护理，弄出来就是一个吞钱的无底洞。一段时间荒废那就废了，河道几乎无法行使船只。还在后来出现了一个什么“漕帮”，闹出很多不好的事情。